Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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CHD4Q14839 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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CHD4Q14839 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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CHD4Q14839 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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CHD4Q14839 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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CHD4Q14839 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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