Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL4A6Q14031 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL4A6Q14031 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL4A6Q14031 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL4A6Q14031 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL4A6Q14031 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL4A6Q14031 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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COL4A6Q14031 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL4A6Q14031 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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COL4A6Q14031 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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COL4A6Q14031 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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COL4A6Q14031 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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COL4A6Q14031 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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COL4A6Q14031 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL4A6Q14031 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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