Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
NCOA4Q13772 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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NCOA4Q13772 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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NCOA4Q13772 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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NCOA4Q13772 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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NCOA4Q13772 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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NCOA4Q13772 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NCOA4Q13772 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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