Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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