Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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TCOF1Q13428 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TCOF1Q13428 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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