Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
AP3B2Q13367 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
AP3B2Q13367 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
AP3B2Q13367 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
AP3B2Q13367 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
AP3B2Q13367 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
AP3B2Q13367 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
AP3B2Q13367 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms