Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
NME3Q13232 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms