Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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