Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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