Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms