Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms