Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms