Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PGGT1BP53609 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms