Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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