Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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PTPRBP23467 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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PTPRBP23467 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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PTPRBP23467 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRBP23467 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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