Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PTPRCP08575 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPRCP08575 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPRCP08575 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPRCP08575 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPRCP08575 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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PTPRCP08575 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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