Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ERVV-1B6SEH8 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERVV-1B6SEH8 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERVV-1B6SEH8 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
ERVV-1B6SEH8 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms