Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PARP3Q9Y6F1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PARP3Q9Y6F1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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