Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA1Q9UJY5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms