Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sorbs3Q9R1Z8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms