Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms