Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DLL3Q9NYJ7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms