Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX54Q8TDD1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms