Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARRDC4Q8NCT1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARRDC4Q8NCT1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms