Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOGA3Q5TF21 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms