Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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