Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SP140Q13342 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SP140Q13342 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SP140Q13342 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SP140Q13342 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SP140Q13342 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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SP140Q13342 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SP140Q13342 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SP140Q13342 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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