Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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