Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRDM2Q13029 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
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