Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP7AQ04656 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms