Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPCQ01831 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPCQ01831 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPCQ01831 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPCQ01831 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPCQ01831 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPCQ01831 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPCQ01831 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPCQ01831 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPCQ01831 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPCQ01831 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPCQ01831 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPCQ01831 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPCQ01831 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPCQ01831 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPCQ01831 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPCQ01831 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPCQ01831 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPCQ01831 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPCQ01831 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPCQ01831 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
XPCQ01831 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms