Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms