Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFDNP55196 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFDNP55196 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFDNP55196 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFDNP55196 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFDNP55196 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFDNP55196 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFDNP55196 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFDNP55196 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFDNP55196 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFDNP55196 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFDNP55196 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFDNP55196 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFDNP55196 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFDNP55196 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AFDNP55196 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms