Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHB3P54753 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB3P54753 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms