Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP1P48552 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP1P48552 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms