Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms