Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ABCC1P33527 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC1P33527 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms