Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TM4SF1P30408 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TM4SF1P30408 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms