Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGB2P26583 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms