Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCP2P22307 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCP2P22307 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCP2P22307 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SCP2P22307 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCP2P22307 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCP2P22307 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms