Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGFRP00533 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGFRP00533 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EGFRP00533 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGFRP00533 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGFRP00533 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms