Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Casq1O09165 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Casq1O09165 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Casq1O09165 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Casq1O09165 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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