Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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ARL2-SNX15V9GYD0 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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ARL2-SNX15V9GYD0 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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ARL2-SNX15V9GYD0 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ARL2-SNX15V9GYD0 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
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