Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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