Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
GTF3C6Q969F1 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms