Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SS18Q15532 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SS18Q15532 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms