Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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SEC23BQ15437 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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SEC23BQ15437 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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SEC23BQ15437 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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