Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAM2Q15035 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms