Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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CHD4Q14839 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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CHD4Q14839 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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CHD4Q14839 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CHD4Q14839 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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CHD4Q14839 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
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CHD4Q14839 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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