Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms